خود قسمتى از قرآن مجيد شامل چند سورهء مباركه از قرآن را تفسير نموده و اجل مهلت به اتمام آن را نداده است . نسخهء اصل به خط مؤلف نزد حفيد وى محقق معاصر سيد صالح شهرستانى در شميران محفوظ است . منابع : اعيان الشيعة ، 10 / 163 ؛ الفوائد الرضوية ، 670 ؛ معارف الرجال ، 3 / 84 ؛ معجم الدراسات القرآنية ، 80 ؛ وحيد بهبهانى ، 178 . السر المصون فى نكتة الاظهار و الاضمار فى اكثر الناس و اكثرهم لا يعلمون ، اثر سيد على ( 1171 - 1219 ق ) فرزند سيد ابراهيم بن محمد حسنى يمانى صنعانى آل امير ، از ادبا و شعرا و عرفا و متكلمان زيديه . اين تفسير به عربى و در يك جلد بزرگ شامل شرح آيات قرآن كريم كه حاوى كلمهء « الاظهار » و كلمهء « الاضمار » مىباشد . نسخه‌اى از اين تفسير در كتابخانهء جامع الكبير صنعا ( شمارهء 60 م ) موجود است . منابع : الاعلام ، 4 / 252 ؛ البدر الطالع ، 1 / 420 ؛ ايضاح المكنون ، 2 / 664 ؛ معجم المؤلفين ، 7 / 7 ؛ مؤلفات الزيدية ، 2 / 89 ؛ هدية العارفين ، 1 / 774 ؛ نيل الوطر ، 2 / 110 . تحفة الابرار فى تفسير القرآن ، اثر ملا محمد ملائكه برغانى قزوينى ( م 1220 ق ) ، از علماى شيعه ( براى شرح‌حال او - برغانى ، محمد ملائكه ، دائرة المعارف تشيع ، 3 / 182 ) . تفسير مورد بحث در دو مجلد بزرگ به زبان عربى و به شيوهء كلامى است كه از روايات نيز در تفسير آيات قرآن سود جسته است . و در تأويل و تفسير بعضى از آيات قرآن‌كه امكان عنوان كردن مباحث فلسفى وجود داشته به‌طور گسترده وارد بحثهاى فلسفى گرديده است . نسخهء اصل منحصر به‌فرد به خط مؤلف نزد حفيد مفسر شيخ ملا محمد شهيدى در برغان موجود است . منابع : سيرة آل برغانى ، آقا بزرگ تهرانى ( خطى ) ؛ الغرر و الدرر ، 2 ( خطى ) ؛ مستدركات اعيان